Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EGFRP00533 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EGFRP00533 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EGFRP00533 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EGFRP00533 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EGFRP00533 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EGFRP00533 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
EGFRP00533 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
EGFRP00533 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EGFRP00533 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EGFRP00533 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
EGFRP00533 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EGFRP00533 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EGFRP00533 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EGFRP00533 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EGFRP00533 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EGFRP00533 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EGFRP00533 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EGFRP00533 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EGFRP00533 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EGFRP00533 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EGFRP00533 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EGFRP00533 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EGFRP00533 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EGFRP00533 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EGFRP00533 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EGFRP00533 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EGFRP00533 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EGFRP00533 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EGFRP00533 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EGFRP00533 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EGFRP00533 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EGFRP00533 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EGFRP00533 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EGFRP00533 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EGFRP00533 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EGFRP00533 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EGFRP00533 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
EGFRP00533 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EGFRP00533 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EGFRP00533 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EGFRP00533 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EGFRP00533 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EGFRP00533 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
EGFRP00533 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
EGFRP00533 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29■■■□□ 2.23
EGFRP00533 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
EGFRP00533 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EGFRP00533 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EGFRP00533 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EGFRP00533 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EGFRP00533 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EGFRP00533 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EGFRP00533 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EGFRP00533 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EGFRP00533 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EGFRP00533 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EGFRP00533 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EGFRP00533 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EGFRP00533 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EGFRP00533 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EGFRP00533 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EGFRP00533 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EGFRP00533 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EGFRP00533 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EGFRP00533 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EGFRP00533 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EGFRP00533 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EGFRP00533 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
EGFRP00533 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
EGFRP00533 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EGFRP00533 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
EGFRP00533 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
EGFRP00533 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
EGFRP00533 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
EGFRP00533 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
EGFRP00533 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
EGFRP00533 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
EGFRP00533 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EGFRP00533 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EGFRP00533 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EGFRP00533 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EGFRP00533 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EGFRP00533 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EGFRP00533 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EGFRP00533 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EGFRP00533 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EGFRP00533 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EGFRP00533 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
EGFRP00533 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EGFRP00533 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EGFRP00533 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EGFRP00533 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
EGFRP00533 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EGFRP00533 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EGFRP00533 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EGFRP00533 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EGFRP00533 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EGFRP00533 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EGFRP00533 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms