Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ECM2O94769 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ECM2O94769 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ECM2O94769 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ECM2O94769 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ECM2O94769 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ECM2O94769 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ECM2O94769 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ECM2O94769 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ECM2O94769 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ECM2O94769 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ECM2O94769 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ECM2O94769 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ECM2O94769 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ECM2O94769 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ECM2O94769 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ECM2O94769 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ECM2O94769 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ECM2O94769 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ECM2O94769 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ECM2O94769 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ECM2O94769 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ECM2O94769 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ECM2O94769 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ECM2O94769 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ECM2O94769 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ECM2O94769 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ECM2O94769 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ECM2O94769 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ECM2O94769 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ECM2O94769 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ECM2O94769 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ECM2O94769 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ECM2O94769 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ECM2O94769 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ECM2O94769 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ECM2O94769 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ECM2O94769 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ECM2O94769 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ECM2O94769 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ECM2O94769 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ECM2O94769 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ECM2O94769 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ECM2O94769 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ECM2O94769 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ECM2O94769 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ECM2O94769 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ECM2O94769 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ECM2O94769 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ECM2O94769 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ECM2O94769 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ECM2O94769 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ECM2O94769 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ECM2O94769 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ECM2O94769 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ECM2O94769 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ECM2O94769 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ECM2O94769 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ECM2O94769 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ECM2O94769 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ECM2O94769 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ECM2O94769 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ECM2O94769 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ECM2O94769 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ECM2O94769 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ECM2O94769 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ECM2O94769 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ECM2O94769 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ECM2O94769 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ECM2O94769 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ECM2O94769 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ECM2O94769 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ECM2O94769 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ECM2O94769 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ECM2O94769 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ECM2O94769 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ECM2O94769 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ECM2O94769 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ECM2O94769 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ECM2O94769 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ECM2O94769 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ECM2O94769 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ECM2O94769 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ECM2O94769 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ECM2O94769 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ECM2O94769 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ECM2O94769 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ECM2O94769 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ECM2O94769 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ECM2O94769 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ECM2O94769 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ECM2O94769 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ECM2O94769 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ECM2O94769 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ECM2O94769 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ECM2O94769 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ECM2O94769 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ECM2O94769 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ECM2O94769 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ECM2O94769 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms