Protein–RNA interactions for Protein: O76015

KRT38, Keratin, type I cuticular Ha8, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT38O76015 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT38O76015 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT38O76015 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT38O76015 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT38O76015 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT38O76015 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT38O76015 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT38O76015 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT38O76015 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT38O76015 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT38O76015 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT38O76015 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT38O76015 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT38O76015 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT38O76015 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT38O76015 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT38O76015 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT38O76015 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT38O76015 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT38O76015 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT38O76015 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT38O76015 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT38O76015 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT38O76015 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT38O76015 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT38O76015 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT38O76015 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT38O76015 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT38O76015 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT38O76015 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT38O76015 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT38O76015 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT38O76015 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT38O76015 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT38O76015 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT38O76015 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT38O76015 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT38O76015 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT38O76015 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT38O76015 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT38O76015 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT38O76015 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT38O76015 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT38O76015 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT38O76015 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT38O76015 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT38O76015 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT38O76015 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT38O76015 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT38O76015 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT38O76015 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT38O76015 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT38O76015 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT38O76015 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT38O76015 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT38O76015 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT38O76015 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT38O76015 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT38O76015 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT38O76015 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT38O76015 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT38O76015 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT38O76015 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT38O76015 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT38O76015 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT38O76015 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT38O76015 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT38O76015 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT38O76015 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT38O76015 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT38O76015 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT38O76015 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT38O76015 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT38O76015 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT38O76015 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT38O76015 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT38O76015 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT38O76015 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT38O76015 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
KRT38O76015 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT38O76015 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT38O76015 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT38O76015 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT38O76015 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT38O76015 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT38O76015 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT38O76015 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT38O76015 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT38O76015 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT38O76015 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT38O76015 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT38O76015 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT38O76015 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT38O76015 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT38O76015 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT38O76015 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT38O76015 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT38O76015 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT38O76015 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT38O76015 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms