Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF40O75150 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF40O75150 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF40O75150 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF40O75150 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF40O75150 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF40O75150 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF40O75150 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF40O75150 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF40O75150 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF40O75150 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF40O75150 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF40O75150 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF40O75150 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF40O75150 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF40O75150 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF40O75150 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF40O75150 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF40O75150 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF40O75150 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF40O75150 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF40O75150 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF40O75150 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF40O75150 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF40O75150 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF40O75150 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF40O75150 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF40O75150 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF40O75150 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF40O75150 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RNF40O75150 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF40O75150 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF40O75150 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF40O75150 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF40O75150 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF40O75150 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF40O75150 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF40O75150 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF40O75150 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF40O75150 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF40O75150 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF40O75150 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF40O75150 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF40O75150 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF40O75150 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF40O75150 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF40O75150 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF40O75150 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF40O75150 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF40O75150 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF40O75150 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF40O75150 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF40O75150 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF40O75150 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF40O75150 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF40O75150 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF40O75150 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF40O75150 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF40O75150 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF40O75150 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF40O75150 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF40O75150 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF40O75150 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF40O75150 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF40O75150 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF40O75150 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF40O75150 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF40O75150 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF40O75150 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF40O75150 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF40O75150 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF40O75150 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF40O75150 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF40O75150 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF40O75150 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF40O75150 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF40O75150 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF40O75150 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF40O75150 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF40O75150 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF40O75150 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF40O75150 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF40O75150 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF40O75150 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF40O75150 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF40O75150 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF40O75150 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF40O75150 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF40O75150 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF40O75150 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF40O75150 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF40O75150 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF40O75150 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF40O75150 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF40O75150 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF40O75150 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF40O75150 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF40O75150 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF40O75150 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF40O75150 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms