Protein–RNA interactions for Protein: O60229

KALRN, Kalirin, humanhuman

Predictions only

Length 2,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KALRNO60229 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KALRNO60229 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KALRNO60229 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KALRNO60229 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KALRNO60229 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KALRNO60229 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KALRNO60229 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KALRNO60229 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KALRNO60229 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KALRNO60229 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KALRNO60229 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KALRNO60229 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KALRNO60229 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KALRNO60229 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KALRNO60229 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KALRNO60229 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KALRNO60229 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KALRNO60229 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KALRNO60229 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KALRNO60229 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KALRNO60229 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KALRNO60229 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KALRNO60229 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KALRNO60229 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KALRNO60229 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KALRNO60229 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KALRNO60229 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KALRNO60229 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KALRNO60229 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KALRNO60229 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KALRNO60229 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KALRNO60229 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KALRNO60229 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KALRNO60229 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KALRNO60229 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KALRNO60229 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KALRNO60229 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KALRNO60229 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KALRNO60229 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KALRNO60229 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KALRNO60229 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KALRNO60229 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KALRNO60229 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KALRNO60229 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KALRNO60229 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KALRNO60229 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KALRNO60229 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KALRNO60229 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KALRNO60229 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KALRNO60229 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KALRNO60229 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KALRNO60229 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KALRNO60229 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KALRNO60229 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KALRNO60229 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KALRNO60229 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KALRNO60229 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KALRNO60229 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KALRNO60229 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KALRNO60229 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KALRNO60229 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KALRNO60229 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KALRNO60229 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KALRNO60229 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KALRNO60229 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KALRNO60229 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KALRNO60229 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KALRNO60229 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KALRNO60229 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KALRNO60229 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KALRNO60229 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KALRNO60229 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KALRNO60229 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KALRNO60229 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KALRNO60229 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KALRNO60229 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KALRNO60229 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KALRNO60229 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
KALRNO60229 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KALRNO60229 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KALRNO60229 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KALRNO60229 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KALRNO60229 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KALRNO60229 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KALRNO60229 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KALRNO60229 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KALRNO60229 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KALRNO60229 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KALRNO60229 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KALRNO60229 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KALRNO60229 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KALRNO60229 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KALRNO60229 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KALRNO60229 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KALRNO60229 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KALRNO60229 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KALRNO60229 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KALRNO60229 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KALRNO60229 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KALRNO60229 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms