Protein–RNA interactions for Protein: O15446

CD3EAP, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD3EAPO15446 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD3EAPO15446 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD3EAPO15446 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD3EAPO15446 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD3EAPO15446 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CD3EAPO15446 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD3EAPO15446 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD3EAPO15446 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD3EAPO15446 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD3EAPO15446 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD3EAPO15446 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD3EAPO15446 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD3EAPO15446 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD3EAPO15446 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD3EAPO15446 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD3EAPO15446 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD3EAPO15446 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD3EAPO15446 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD3EAPO15446 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD3EAPO15446 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD3EAPO15446 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD3EAPO15446 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD3EAPO15446 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD3EAPO15446 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD3EAPO15446 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD3EAPO15446 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CD3EAPO15446 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD3EAPO15446 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD3EAPO15446 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD3EAPO15446 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD3EAPO15446 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD3EAPO15446 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CD3EAPO15446 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD3EAPO15446 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD3EAPO15446 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD3EAPO15446 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD3EAPO15446 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD3EAPO15446 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD3EAPO15446 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD3EAPO15446 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD3EAPO15446 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD3EAPO15446 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD3EAPO15446 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD3EAPO15446 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD3EAPO15446 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD3EAPO15446 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD3EAPO15446 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD3EAPO15446 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD3EAPO15446 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD3EAPO15446 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD3EAPO15446 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD3EAPO15446 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD3EAPO15446 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD3EAPO15446 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD3EAPO15446 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD3EAPO15446 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD3EAPO15446 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD3EAPO15446 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CD3EAPO15446 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD3EAPO15446 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD3EAPO15446 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD3EAPO15446 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD3EAPO15446 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD3EAPO15446 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD3EAPO15446 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD3EAPO15446 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD3EAPO15446 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD3EAPO15446 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD3EAPO15446 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD3EAPO15446 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD3EAPO15446 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CD3EAPO15446 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CD3EAPO15446 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD3EAPO15446 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD3EAPO15446 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD3EAPO15446 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD3EAPO15446 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD3EAPO15446 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD3EAPO15446 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD3EAPO15446 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD3EAPO15446 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CD3EAPO15446 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD3EAPO15446 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD3EAPO15446 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD3EAPO15446 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD3EAPO15446 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD3EAPO15446 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD3EAPO15446 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD3EAPO15446 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD3EAPO15446 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD3EAPO15446 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD3EAPO15446 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD3EAPO15446 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD3EAPO15446 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD3EAPO15446 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD3EAPO15446 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CD3EAPO15446 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD3EAPO15446 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD3EAPO15446 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CD3EAPO15446 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms