Protein–RNA interactions for Protein: O14521

SDHD, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHDO14521 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDHDO14521 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDHDO14521 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDHDO14521 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDHDO14521 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDHDO14521 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDHDO14521 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDHDO14521 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDHDO14521 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDHDO14521 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDHDO14521 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDHDO14521 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDHDO14521 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDHDO14521 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDHDO14521 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SDHDO14521 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDHDO14521 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDHDO14521 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDHDO14521 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHDO14521 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHDO14521 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHDO14521 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHDO14521 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHDO14521 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHDO14521 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHDO14521 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHDO14521 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHDO14521 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHDO14521 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHDO14521 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHDO14521 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHDO14521 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHDO14521 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHDO14521 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHDO14521 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHDO14521 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHDO14521 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHDO14521 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHDO14521 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHDO14521 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHDO14521 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHDO14521 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHDO14521 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHDO14521 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHDO14521 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDHDO14521 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDHDO14521 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDHDO14521 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDHDO14521 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDHDO14521 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDHDO14521 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDHDO14521 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDHDO14521 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDHDO14521 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDHDO14521 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDHDO14521 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDHDO14521 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDHDO14521 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SDHDO14521 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDHDO14521 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SDHDO14521 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDHDO14521 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDHDO14521 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDHDO14521 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDHDO14521 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDHDO14521 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDHDO14521 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDHDO14521 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDHDO14521 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SDHDO14521 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDHDO14521 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDHDO14521 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDHDO14521 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDHDO14521 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDHDO14521 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDHDO14521 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDHDO14521 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDHDO14521 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SDHDO14521 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDHDO14521 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SDHDO14521 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SDHDO14521 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDHDO14521 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDHDO14521 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDHDO14521 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDHDO14521 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDHDO14521 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDHDO14521 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDHDO14521 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDHDO14521 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDHDO14521 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDHDO14521 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDHDO14521 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDHDO14521 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDHDO14521 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDHDO14521 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDHDO14521 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDHDO14521 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDHDO14521 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SDHDO14521 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms