Protein–RNA interactions for Protein: O13559

YRF1-4, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 4, yeastyeast

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-4O13559 PEX13YLR191W 1161 nt7.69□□□□□ -1.18
YRF1-4O13559 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt7.69□□□□□ -1.18
YRF1-4O13559 ATG12YBR217W 561 nt7.69□□□□□ -1.18
YRF1-4O13559 PKC1YBL105C 3456 nt7.69□□□□□ -1.18
YRF1-4O13559 PUF3YLL013C 2640 nt7.68□□□□□ -1.18
YRF1-4O13559 EFM4YIL064W 774 nt7.68□□□□□ -1.18
YRF1-4O13559 SEC13YLR208W 894 nt7.68□□□□□ -1.18
YRF1-4O13559 PNP1YLR209C 936 nt7.68□□□□□ -1.18
YRF1-4O13559 MRPS5YBR251W 924 nt7.68□□□□□ -1.18
YRF1-4O13559 PYK2YOR347C 1521 nt7.68□□□□□ -1.18
YRF1-4O13559 CBP4YGR174C 513 nt7.67□□□□□ -1.18
YRF1-4O13559 PRI2YKL045W 1587 nt7.66□□□□□ -1.18
YRF1-4O13559 ARG81YML099C 2643 nt7.66□□□□□ -1.18
YRF1-4O13559 TPO3YPR156C 1869 nt7.66□□□□□ -1.18
YRF1-4O13559 MRK1YDL079C 1506 nt7.66□□□□□ -1.18
YRF1-4O13559 SPT3YDR392W 1014 nt7.66□□□□□ -1.18
YRF1-4O13559 ICS3YJL077C 396 nt7.66□□□□□ -1.18
YRF1-4O13559 MRP17YKL003C 396 nt7.66□□□□□ -1.18
YRF1-4O13559 MRPL22YNL177C 930 nt7.66□□□□□ -1.18
YRF1-4O13559 RGT2YDL138W 2292 nt7.65□□□□□ -1.18
YRF1-4O13559 CBK1YNL161W 2271 nt7.65□□□□□ -1.18
YRF1-4O13559 LDB18YLL049W 540 nt7.65□□□□□ -1.18
YRF1-4O13559 TSA1YML028W 591 nt7.65□□□□□ -1.18
YRF1-4O13559 COA1YIL157C 594 nt7.64□□□□□ -1.19
YRF1-4O13559 MOD5YOR274W 1287 nt7.64□□□□□ -1.19
YRF1-4O13559 GPI11YDR302W 660 nt7.63□□□□□ -1.19
YRF1-4O13559 MGM101YJR144W 810 nt7.63□□□□□ -1.19
YRF1-4O13559 HAP3YBL021C 435 nt7.63□□□□□ -1.19
YRF1-4O13559 YPR114WYPR114W 948 nt7.63□□□□□ -1.19
YRF1-4O13559 GUD1YDL238C 1470 nt7.63□□□□□ -1.19
YRF1-4O13559 EDC3YEL015W 1656 nt7.63□□□□□ -1.19
YRF1-4O13559 YPR204WYPR204W 3099 nt7.62□□□□□ -1.19
YRF1-4O13559 FPR2YDR519W 408 nt7.62□□□□□ -1.19
YRF1-4O13559 YEL068CYEL068C 333 nt7.62□□□□□ -1.19
YRF1-4O13559 SYN8YAL014C 768 nt7.62□□□□□ -1.19
YRF1-4O13559 HDA1YNL021W 2121 nt7.62□□□□□ -1.19
YRF1-4O13559 ARG1YOL058W 1263 nt7.62□□□□□ -1.19
YRF1-4O13559 AAD15YOL165C 432 nt7.62□□□□□ -1.19
YRF1-4O13559 CMK2YOL016C 1344 nt7.62□□□□□ -1.19
YRF1-4O13559 WHI2YOR043W 1461 nt7.61□□□□□ -1.19
YRF1-4O13559 QCR6YFR033C 444 nt7.61□□□□□ -1.19
YRF1-4O13559 YGR022CYGR022C 330 nt7.61□□□□□ -1.19
YRF1-4O13559 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt7.61□□□□□ -1.19
YRF1-4O13559 MRPS16YPL013C 366 nt7.6□□□□□ -1.19
YRF1-4O13559 YJL045WYJL045W 1905 nt7.6□□□□□ -1.19
YRF1-4O13559 ICL2YPR006C 1728 nt7.6□□□□□ -1.19
YRF1-4O13559 MCM3YEL032W 2916 nt7.59□□□□□ -1.19
YRF1-4O13559 DMA1YHR115C 1251 nt7.59□□□□□ -1.19
YRF1-4O13559 ERI1YPL096C-A 207 nt7.59□□□□□ -1.19
YRF1-4O13559 CDC13YDL220C 2775 nt7.59□□□□□ -1.19
YRF1-4O13559 AFG1YEL052W 1530 nt7.59□□□□□ -1.19
YRF1-4O13559 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt7.59□□□□□ -1.2
YRF1-4O13559 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt7.59□□□□□ -1.2
YRF1-4O13559 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt7.59□□□□□ -1.2
YRF1-4O13559 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt7.59□□□□□ -1.2
YRF1-4O13559 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt7.59□□□□□ -1.2
YRF1-4O13559 VMA16YHR026W 642 nt7.59□□□□□ -1.2
YRF1-4O13559 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt7.59□□□□□ -1.2
YRF1-4O13559 RAD24YER173W 1980 nt7.58□□□□□ -1.2
YRF1-4O13559 LEU5YHR002W 1074 nt7.58□□□□□ -1.2
YRF1-4O13559 YHR131CYHR131C 2553 nt7.57□□□□□ -1.2
YRF1-4O13559 CLN1YMR199W 1641 nt7.57□□□□□ -1.2
YRF1-4O13559 YCR061WYCR061W 1896 nt7.57□□□□□ -1.2
YRF1-4O13559 ATG4YNL223W 1485 nt7.56□□□□□ -1.2
YRF1-4O13559 DCN1YLR128W 810 nt7.56□□□□□ -1.2
YRF1-4O13559 MDH3YDL078C 1032 nt7.55□□□□□ -1.2
YRF1-4O13559 GTT3YEL017W 1014 nt7.55□□□□□ -1.2
YRF1-4O13559 GLN1YPR035W 1113 nt7.55□□□□□ -1.2
YRF1-4O13559 HEL1YKR017C 1656 nt7.55□□□□□ -1.2
YRF1-4O13559 IME2YJL106W 1938 nt7.54□□□□□ -1.2
YRF1-4O13559 YDL057WYDL057W 987 nt7.54□□□□□ -1.2
YRF1-4O13559 YFL064CYFL064C 525 nt7.54□□□□□ -1.2
YRF1-4O13559 YPR202WYPR202W 717 nt7.54□□□□□ -1.2
YRF1-4O13559 CCP1YKR066C 1086 nt7.53□□□□□ -1.2
YRF1-4O13559 LST8YNL006W 912 nt7.53□□□□□ -1.2
YRF1-4O13559 TEP1YNL128W 1305 nt7.52□□□□□ -1.21
YRF1-4O13559 ARP2YDL029W 1176 nt7.52□□□□□ -1.21
YRF1-4O13559 PYC2YBR218C 3543 nt7.52□□□□□ -1.21
YRF1-4O13559 SMC5YOL034W 3282 nt7.52□□□□□ -1.21
YRF1-4O13559 RPT3YDR394W 1287 nt7.51□□□□□ -1.21
YRF1-4O13559 UBC11YOR339C 471 nt7.51□□□□□ -1.21
YRF1-4O13559 SSO1YPL232W 873 nt7.51□□□□□ -1.21
YRF1-4O13559 ADE13YLR359W 1449 nt7.51□□□□□ -1.21
YRF1-4O13559 KEL1YHR158C 3495 nt7.51□□□□□ -1.21
YRF1-4O13559 TEA1YOR337W 2280 nt7.5□□□□□ -1.21
YRF1-4O13559 YDR278CYDR278C 318 nt7.5□□□□□ -1.21
YRF1-4O13559 YLR194CYLR194C 765 nt7.5□□□□□ -1.21
YRF1-4O13559 YHM2YMR241W 945 nt7.5□□□□□ -1.21
YRF1-4O13559 HSP26YBR072W 645 nt7.5□□□□□ -1.21
YRF1-4O13559 KKQ8YKL168C 2175 nt7.5□□□□□ -1.21
YRF1-4O13559 PET112YBL080C 1626 nt7.49□□□□□ -1.21
YRF1-4O13559 BCY1YIL033C 1251 nt7.49□□□□□ -1.21
YRF1-4O13559 MLC1YGL106W 450 nt7.48□□□□□ -1.21
YRF1-4O13559 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt7.48□□□□□ -1.21
YRF1-4O13559 SFC1YJR095W 969 nt7.48□□□□□ -1.21
YRF1-4O13559 EFM3YJR129C 1020 nt7.48□□□□□ -1.21
YRF1-4O13559 CNE1YAL058W 1509 nt7.48□□□□□ -1.21
YRF1-4O13559 KNH1YDL049C 807 nt7.47□□□□□ -1.21
YRF1-4O13559 YKL031WYKL031W 414 nt7.47□□□□□ -1.21
YRF1-4O13559 DUS4YLR405W 1104 nt7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.9 ms