Protein–RNA interactions for Protein: O00743

PPP6C, Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP6CO00743 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP6CO00743 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP6CO00743 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP6CO00743 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP6CO00743 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP6CO00743 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP6CO00743 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP6CO00743 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP6CO00743 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP6CO00743 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP6CO00743 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP6CO00743 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP6CO00743 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP6CO00743 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms