Protein–RNA interactions for Protein: O00408

PDE2A, cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE2AO00408 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDE2AO00408 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE2AO00408 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE2AO00408 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE2AO00408 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE2AO00408 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE2AO00408 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE2AO00408 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE2AO00408 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE2AO00408 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE2AO00408 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE2AO00408 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE2AO00408 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE2AO00408 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE2AO00408 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE2AO00408 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE2AO00408 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE2AO00408 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE2AO00408 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE2AO00408 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE2AO00408 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE2AO00408 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE2AO00408 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE2AO00408 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE2AO00408 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE2AO00408 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE2AO00408 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE2AO00408 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE2AO00408 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE2AO00408 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE2AO00408 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms