Protein–RNA interactions for Protein: O00358

FOXE1, Forkhead box protein E1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE1O00358 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXE1O00358 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXE1O00358 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXE1O00358 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXE1O00358 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXE1O00358 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXE1O00358 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXE1O00358 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXE1O00358 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXE1O00358 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXE1O00358 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXE1O00358 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXE1O00358 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXE1O00358 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXE1O00358 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXE1O00358 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXE1O00358 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXE1O00358 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXE1O00358 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXE1O00358 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXE1O00358 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXE1O00358 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXE1O00358 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXE1O00358 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXE1O00358 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXE1O00358 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXE1O00358 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXE1O00358 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXE1O00358 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXE1O00358 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXE1O00358 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXE1O00358 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXE1O00358 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXE1O00358 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXE1O00358 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXE1O00358 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXE1O00358 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXE1O00358 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXE1O00358 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXE1O00358 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXE1O00358 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXE1O00358 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXE1O00358 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXE1O00358 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXE1O00358 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXE1O00358 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXE1O00358 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXE1O00358 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXE1O00358 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXE1O00358 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXE1O00358 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXE1O00358 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXE1O00358 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXE1O00358 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXE1O00358 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXE1O00358 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXE1O00358 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXE1O00358 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXE1O00358 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms