Protein–RNA interactions for Protein: B2RXH2

KDM4E, Lysine-specific demethylase 4E, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4EB2RXH2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM4EB2RXH2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM4EB2RXH2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM4EB2RXH2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM4EB2RXH2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM4EB2RXH2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM4EB2RXH2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4EB2RXH2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4EB2RXH2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4EB2RXH2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4EB2RXH2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4EB2RXH2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4EB2RXH2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4EB2RXH2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4EB2RXH2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4EB2RXH2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4EB2RXH2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4EB2RXH2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4EB2RXH2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4EB2RXH2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4EB2RXH2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4EB2RXH2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4EB2RXH2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4EB2RXH2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4EB2RXH2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4EB2RXH2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4EB2RXH2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4EB2RXH2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4EB2RXH2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4EB2RXH2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4EB2RXH2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4EB2RXH2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4EB2RXH2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4EB2RXH2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM4EB2RXH2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM4EB2RXH2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM4EB2RXH2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM4EB2RXH2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms