Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LINC00587B1AMM8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms