Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VGLL3A8MV65 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VGLL3A8MV65 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VGLL3A8MV65 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VGLL3A8MV65 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VGLL3A8MV65 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VGLL3A8MV65 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VGLL3A8MV65 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VGLL3A8MV65 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VGLL3A8MV65 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VGLL3A8MV65 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VGLL3A8MV65 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VGLL3A8MV65 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VGLL3A8MV65 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VGLL3A8MV65 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VGLL3A8MV65 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VGLL3A8MV65 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VGLL3A8MV65 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VGLL3A8MV65 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VGLL3A8MV65 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VGLL3A8MV65 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VGLL3A8MV65 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VGLL3A8MV65 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VGLL3A8MV65 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VGLL3A8MV65 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VGLL3A8MV65 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VGLL3A8MV65 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VGLL3A8MV65 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VGLL3A8MV65 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VGLL3A8MV65 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VGLL3A8MV65 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VGLL3A8MV65 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VGLL3A8MV65 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VGLL3A8MV65 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VGLL3A8MV65 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VGLL3A8MV65 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VGLL3A8MV65 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VGLL3A8MV65 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VGLL3A8MV65 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VGLL3A8MV65 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VGLL3A8MV65 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VGLL3A8MV65 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms