Protein–RNA interactions for Protein: A6NI56

CCDC154, Coiled-coil domain-containing protein 154, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC154A6NI56 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC154A6NI56 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC154A6NI56 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms