Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VWA3AA6NCI4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VWA3AA6NCI4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VWA3AA6NCI4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VWA3AA6NCI4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VWA3AA6NCI4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VWA3AA6NCI4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VWA3AA6NCI4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VWA3AA6NCI4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
VWA3AA6NCI4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VWA3AA6NCI4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
VWA3AA6NCI4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VWA3AA6NCI4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VWA3AA6NCI4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VWA3AA6NCI4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VWA3AA6NCI4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VWA3AA6NCI4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VWA3AA6NCI4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VWA3AA6NCI4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VWA3AA6NCI4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VWA3AA6NCI4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VWA3AA6NCI4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VWA3AA6NCI4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
VWA3AA6NCI4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VWA3AA6NCI4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VWA3AA6NCI4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VWA3AA6NCI4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VWA3AA6NCI4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VWA3AA6NCI4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VWA3AA6NCI4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
VWA3AA6NCI4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VWA3AA6NCI4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VWA3AA6NCI4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VWA3AA6NCI4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VWA3AA6NCI4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VWA3AA6NCI4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VWA3AA6NCI4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VWA3AA6NCI4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VWA3AA6NCI4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VWA3AA6NCI4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VWA3AA6NCI4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
VWA3AA6NCI4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VWA3AA6NCI4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VWA3AA6NCI4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VWA3AA6NCI4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VWA3AA6NCI4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VWA3AA6NCI4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VWA3AA6NCI4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VWA3AA6NCI4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VWA3AA6NCI4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VWA3AA6NCI4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VWA3AA6NCI4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VWA3AA6NCI4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VWA3AA6NCI4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VWA3AA6NCI4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VWA3AA6NCI4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VWA3AA6NCI4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VWA3AA6NCI4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VWA3AA6NCI4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VWA3AA6NCI4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VWA3AA6NCI4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VWA3AA6NCI4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VWA3AA6NCI4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VWA3AA6NCI4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VWA3AA6NCI4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VWA3AA6NCI4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VWA3AA6NCI4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
VWA3AA6NCI4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VWA3AA6NCI4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VWA3AA6NCI4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VWA3AA6NCI4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VWA3AA6NCI4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VWA3AA6NCI4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VWA3AA6NCI4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VWA3AA6NCI4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VWA3AA6NCI4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VWA3AA6NCI4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VWA3AA6NCI4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
VWA3AA6NCI4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VWA3AA6NCI4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VWA3AA6NCI4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
VWA3AA6NCI4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VWA3AA6NCI4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
VWA3AA6NCI4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VWA3AA6NCI4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VWA3AA6NCI4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VWA3AA6NCI4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VWA3AA6NCI4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VWA3AA6NCI4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VWA3AA6NCI4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VWA3AA6NCI4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VWA3AA6NCI4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VWA3AA6NCI4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VWA3AA6NCI4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VWA3AA6NCI4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VWA3AA6NCI4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VWA3AA6NCI4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VWA3AA6NCI4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VWA3AA6NCI4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VWA3AA6NCI4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms