Protein–RNA interactions for Protein: A5PL33

KRBA1, Protein KRBA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA1A5PL33 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRBA1A5PL33 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRBA1A5PL33 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRBA1A5PL33 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRBA1A5PL33 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRBA1A5PL33 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRBA1A5PL33 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRBA1A5PL33 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRBA1A5PL33 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRBA1A5PL33 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRBA1A5PL33 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRBA1A5PL33 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRBA1A5PL33 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRBA1A5PL33 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRBA1A5PL33 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRBA1A5PL33 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRBA1A5PL33 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRBA1A5PL33 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRBA1A5PL33 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRBA1A5PL33 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRBA1A5PL33 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRBA1A5PL33 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRBA1A5PL33 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRBA1A5PL33 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRBA1A5PL33 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRBA1A5PL33 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KRBA1A5PL33 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRBA1A5PL33 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRBA1A5PL33 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRBA1A5PL33 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRBA1A5PL33 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRBA1A5PL33 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRBA1A5PL33 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRBA1A5PL33 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRBA1A5PL33 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRBA1A5PL33 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRBA1A5PL33 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRBA1A5PL33 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRBA1A5PL33 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRBA1A5PL33 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRBA1A5PL33 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRBA1A5PL33 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRBA1A5PL33 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRBA1A5PL33 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRBA1A5PL33 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRBA1A5PL33 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRBA1A5PL33 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRBA1A5PL33 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRBA1A5PL33 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRBA1A5PL33 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRBA1A5PL33 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRBA1A5PL33 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRBA1A5PL33 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRBA1A5PL33 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRBA1A5PL33 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRBA1A5PL33 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRBA1A5PL33 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRBA1A5PL33 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRBA1A5PL33 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRBA1A5PL33 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRBA1A5PL33 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRBA1A5PL33 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KRBA1A5PL33 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRBA1A5PL33 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KRBA1A5PL33 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRBA1A5PL33 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KRBA1A5PL33 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRBA1A5PL33 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRBA1A5PL33 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRBA1A5PL33 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRBA1A5PL33 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRBA1A5PL33 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KRBA1A5PL33 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRBA1A5PL33 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRBA1A5PL33 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KRBA1A5PL33 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRBA1A5PL33 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRBA1A5PL33 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRBA1A5PL33 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRBA1A5PL33 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRBA1A5PL33 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRBA1A5PL33 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRBA1A5PL33 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRBA1A5PL33 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRBA1A5PL33 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRBA1A5PL33 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRBA1A5PL33 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRBA1A5PL33 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRBA1A5PL33 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRBA1A5PL33 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRBA1A5PL33 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRBA1A5PL33 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRBA1A5PL33 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRBA1A5PL33 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRBA1A5PL33 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRBA1A5PL33 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRBA1A5PL33 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRBA1A5PL33 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KRBA1A5PL33 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRBA1A5PL33 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms