Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0U1RRA0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms