Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X0B3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X0B3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A087X0B3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A087X0B3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A087X0B3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A087X0B3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A087X0B3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A087X0B3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A087X0B3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A087X0B3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A087X0B3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A087X0B3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A087X0B3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A087X0B3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A087X0B3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A087X0B3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A087X0B3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A087X0B3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A087X0B3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A087X0B3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A087X0B3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A087X0B3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
A0A087X0B3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
A0A087X0B3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A087X0B3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A087X0B3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A087X0B3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A087X0B3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A087X0B3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A087X0B3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A087X0B3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
A0A087X0B3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
A0A087X0B3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
A0A087X0B3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
A0A087X0B3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
A0A087X0B3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A087X0B3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A087X0B3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A087X0B3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A087X0B3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A087X0B3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A087X0B3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A087X0B3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A087X0B3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A087X0B3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A087X0B3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A087X0B3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A087X0B3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A087X0B3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A087X0B3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A087X0B3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A087X0B3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A087X0B3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A087X0B3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A087X0B3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A087X0B3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A087X0B3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A087X0B3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A087X0B3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A087X0B3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A087X0B3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
A0A087X0B3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
A0A087X0B3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
A0A087X0B3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
A0A087X0B3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.8 ms