Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms