Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNSTRNQ9Y448 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KNSTRNQ9Y448 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms