Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DTX4Q9Y2E6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DTX4Q9Y2E6 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DTX4Q9Y2E6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DTX4Q9Y2E6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DTX4Q9Y2E6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DTX4Q9Y2E6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DTX4Q9Y2E6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DTX4Q9Y2E6 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DTX4Q9Y2E6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX4Q9Y2E6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX4Q9Y2E6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX4Q9Y2E6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX4Q9Y2E6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX4Q9Y2E6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX4Q9Y2E6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX4Q9Y2E6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX4Q9Y2E6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX4Q9Y2E6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX4Q9Y2E6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX4Q9Y2E6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX4Q9Y2E6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX4Q9Y2E6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX4Q9Y2E6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX4Q9Y2E6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX4Q9Y2E6 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX4Q9Y2E6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX4Q9Y2E6 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX4Q9Y2E6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX4Q9Y2E6 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX4Q9Y2E6 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX4Q9Y2E6 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX4Q9Y2E6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX4Q9Y2E6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX4Q9Y2E6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX4Q9Y2E6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX4Q9Y2E6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DTX4Q9Y2E6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms