Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms