Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHOC2Q9UQ13 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms