Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TTF2Q9UNY4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms