Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms