Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms