Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms