Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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RABGEF1Q9UJ41 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RABGEF1Q9UJ41 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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RABGEF1Q9UJ41 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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RABGEF1Q9UJ41 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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RABGEF1Q9UJ41 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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RABGEF1Q9UJ41 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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RABGEF1Q9UJ41 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
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RABGEF1Q9UJ41 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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