Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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