Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms