Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD3Q9P035 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms