Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM7SF3Q9NS93 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TM7SF3Q9NS93 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms