Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms