Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMMDC1Q9NPL8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms