Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLSPNQ9HAW4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms