Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms