Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCAPERQ9BY12 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms