Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VN1R3Q9BXE9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms