Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms