Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHCHD7Q9BUK0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHCHD7Q9BUK0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHCHD7Q9BUK0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHCHD7Q9BUK0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
CHCHD7Q9BUK0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHCHD7Q9BUK0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHCHD7Q9BUK0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHCHD7Q9BUK0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHCHD7Q9BUK0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHCHD7Q9BUK0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHCHD7Q9BUK0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHCHD7Q9BUK0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
CHCHD7Q9BUK0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHCHD7Q9BUK0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHCHD7Q9BUK0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHCHD7Q9BUK0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHCHD7Q9BUK0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHCHD7Q9BUK0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CHCHD7Q9BUK0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms