Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SPOCK3Q9BQ16 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SPOCK3Q9BQ16 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SPOCK3Q9BQ16 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SPOCK3Q9BQ16 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SPOCK3Q9BQ16 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPOCK3Q9BQ16 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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