Protein–RNA interactions for Protein: Q96RW7

HMCN1, Hemicentin-1, humanhuman

Predictions only

Length 5,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMCN1Q96RW7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HMCN1Q96RW7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms