Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms