Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP53Q96M91 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms