Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NBPF4Q96M43 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF4Q96M43 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms