Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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EP400Q96L91 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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EP400Q96L91 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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EP400Q96L91 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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EP400Q96L91 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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