Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDK5RAP3Q96JB5 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms