Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCARF2Q96GP6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms