Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms